1949年4月郑肇经处长提出辞职，当时的国民政府水利部于4月18日任命刘德润为代理处长。1949年4月21日，刘德润处长在杭州与前任郑肇经处长办理交接手续，共移交各种账册、人员名单等32册。其中已经运杭财产有经纬仪、水平仪、求积仪、KE水平仪、显微镜、英文打字机、0702卡车等。每宗所含件数多寡不一，共有30宗。

档案中，属于法令类的有组织法令卷一宗九册、考铨法规卷二十四宗、奖惩抚恤项卷一宗五册、查报事项卷一宗二册、会计事项卷一宗六册、其它事项卷一宗、经常费预算卷一宗五册、请领经费卷一宗、经费计算卷五宗三十四册；属于总务类的有工作报告卷一宗、所得税卷一宗、汽车事项卷一宗二册、借用家具仪器卷一宗、租赁房屋卷一宗五册、襟项卷一宗二册、调整薪饷支给办法卷一宗、仪器财产调查卷一宗二册、还移事项卷一宗三册；属于人事类的有中实处任免卷一宗、请假卷一宗二册、动态月报表卷一宗、晋级加薪卷一宗；属于购置类的有建筑房屋卷三宗九册、购置仪器卷一宗五册；属于试验类的有昆明水工试验室卷二宗、武功水工试验室卷二宗、水利工程试验卷一宗六册、试验襟项卷一宗、仪器制造厂卷三宗、河工实验区卷一宗、成都试验室卷二宗、南京水工所卷一宗五册、天津水工所卷一宗、华中水工所卷一宗；属于制造类的有仪器价目卷一宗、各机关修理仪器卷一宗；属于水文类的有设立西康水文站卷二宗四册、抄送水文记录卷一宗五册、通访事项卷一宗、水文襟件二宗、四川水文站卷二宗八册、云南水文站卷二宗四册、水利航测队卷三宗十三册、接管滇湘水文站一宗、湖南水文站卷二宗六册、接管赣甘陕鲁浙闽等水文测站卷一宗、裁并西南各水文站卷一宗；属于站务类的有河南水文站卷二宗七册、浙江水文站卷二宗五册、福建水文站卷一宗四册、山东水文站卷二宗五册、甘肃水文站卷二宗四册、江西水文站卷二宗四册、安徽水文站卷二宗四册、察哈尔水文站卷二宗四册、热河水文站卷二宗四册、上海市水文站卷二宗三册、陕西水文站卷二宗四册、贵州水文站卷二宗五册、广西水文站卷一宗、台湾水文站卷二宗五册等。已经运杭的杂物，有汽油、装载木箱等22宗。移交人郑肇经，接收人刘德润，监交人吴又新。具体经手人有朱祖璋、顾润华等。

（引自“二史馆”中央水利实验处档案）

移交后的第4天即4月25日，0702卡车（2.5吨,1946年的福特引擎,号码6G621）在杭州被由南京撤退来杭的首都警察鸣枪胁缴而去,文件注明已经报水利部及杭州警察局备案。

从南科院档案查询得知，大陆解放后，中央水利实验处原有的水利航空测量队，以所有航测仪器被运往台湾，暂时无法恢复（见“南京水利实验处一年来工作总结”， 1950年 11月，文书档案目录号1，案卷号12，年度为1950）；之后进一步说明原有水利航空测量队以主要航测仪器被盗运台湾，未能恢复（见“水利部南京水利实验处1949-1955年工作概况”，1956年 12月，科技档案1，计-7，2-1.卷内目录 6）。至此，军地合作建立的这一水利航空测量队便撤销了建制。无独有偶，哈尔滨工业大学查证说：“在旧中国，1930年时只有一个规模很小的从事摄影的航空测量队，隶属于国民政府军事陆地测绘局，主要从事军事地图的测绘，同时承担少量的水利、铁道和地质航摄任务。后来，水利、铁道等部门也组建了航摄队，负责本部门的航摄工作。到1937年，全国共有12架航测飞机。解放前夕，所有航摄飞机、设备和部分航摄资料及技术人员都被国民党劫往台湾。”

台湾大学、成功大学的水工试验所简介等资料中说“民国三十八年中央水利实验处处长朱光彩携带该处部分设备、仪器及图书来台湾。将设备仪器及图书赠给台大与成大”。经查朱光彩不曾在中实处工作，而1948年在任的中实处简任技正兼试验组长、河工实验区主任谭葆泰后来被政府派往联合国有关机构任职。去台后的“中实处”沿袭过去作法，于1950年7月与台湾大学合办台北水工试验室，1950年11日与台湾省立工学院（即后来的成功大学）合办了台南水工试验室。1959年3月在台湾的中央水利实验处被撤消，业务归并于“经济部水资源统一规划委员会”。中央水利实验处在台存续10年，以其名义发表了徐世大的《倒虹吸模型实验》（1953年7月）、徐世大、卢衍祺的《淤积河川特性试验之初步试验》（1953年12月）、毛寿彭的《灌溉量水建筑物研究试验报告》（作者为台大教授，1950.7.1―1973.7.31 兼任台大水工所主任达23年）等文，以及《经济部中央水利实验处编译丛书》（1951年）、《中央水利实验处工作编述》（1953年）等书。

目前设在台大的水工所全名为国立台湾大学农、工学院附设水工试验所，承担水文、水资源、流体力学、泥沙、水利生态等方面的学术性基础研究、应用性研究，以及相关技术推广工作，并为本科生、研究生教学提供设备支持。设在成功大学的水工所全名为经济部水利署、国立成功大学水工试验所，承担海陆域环境调查（包括海洋、河流水文气象观测分析、水质监测分析等）、水工模型试验、数值模拟、数据库及地理信息系统、地层沉陷及水利产业知识化培育等方面的工作。改革开放以来，两所与南京水利科学研究院职工间学术交流日益增多，人员往来日渐频繁，共同为祖国和平统一，造福两岸同胞贡献着力量。

在台的南京水利科学研究院历史档案，现在能查明的存放在两处，即“国史馆”和“中央研究院近代史研究所档案馆”。“中央研究院近代史研究所档案馆” 所存南科院档案又分在全国经济委员会、经济部、水利委员会和水利部等四个上级主管部门的全宗中作为为副全宗保管。从“中央研究院近代史研究所档案馆”检索得知：（1）全国经济委员会档案的时间跨度是1931—1937年，档案内容主要包括水利与农业两部分，经整理编目后，共得539个函套。其中单纯归档于全国经济委员会的水利航空测量队的案卷7卷、函，中央水工试验所总务、人事、建筑图的案卷 1函；（2）1938年1月起，全国经济委员会裁撤，其中经委会水利业务部分均移交新成立的经济部办理，保存在经济部的中央水工试验所档案8卷、函，水利航空测量队档案4卷、函；（3）1934年全经会设有水利委员会，1938年经济部下设水利司，1941年9月，水利司裁撤，水利业务由新成立的行政院水利委员会负责。单纯归档于行政院水利委员会的中央水工试验所、中央水利实验处的案卷包括查勘报告，各水文站、水文气象报告，灌县、石门、磐溪水工试验室、水工仪器工厂、河工实验区等的业务档案，共84卷、函；（4）1947年水利委员会改组为水利部，独立归档于水利部的中央水工试验所、中央水利实验处的档案45卷、函。

全台图书馆联网检索得知，中央水工试验所、中央水利实验处的出版物，现在广泛存放在台湾的各综合图书馆，如“国家图书馆”、“中央图书馆台湾分馆”、台北市立图书馆、高雄市立图书馆等，还存放在台湾各大学图书馆，如台湾大学、成功大学、清华大学、交通大学、中央大学、中山大学、台湾师范大学、中正大学、台湾海洋大学等校的图书馆。这些老书中有的在台湾又再版了四次，有的2002年还在重印。曾在中央水工试验所、中央水利实验处工作的科技人员去台后任大学校长、研究院长、政府技术官员的，连同上述也大有人在。中央水工试验所、中央水利实验处在台湾的影响和对台湾科技教育事业的贡献由此可见一斑。